Монастырь был основан ростовским епископом Иаковом и поначалу назывался Зачатьевским. В 1765 к нему был приписан, располагавшийся рядом, монастырь Спаса на Песках, после чего монастырь стал называться Спасо-Иаковлевским, а после обретения мощей Димитрия Ростовского, к названию прибавилось Димитриевский. В 1928 монастырь был закрыт, на его территории располагались детский сад, склады, жилые помещения. В 1991 монастырь был возвращен верующим.